Det første flyet tok av frå Kjeller i 1912, og det er mykje historie knytt til flyplassen.
I dag er det Forsvarets logistikkorganisasjon (FLO) som driftar Kjeller. Fleire avdelingar i Forsvaret held til her, blant anna frå FLO og Cyberforsvaret. Forsvarsbygg og Forsvarsmateriell har òg einingar på Kjeller. I tillegg held Kongsberg Aviation Maintenance Services (KAMS, tidlegare Luftforsvarets hovudverkstad Kjeller) til på flyplassen.
Flyplassen blir brukt til fly og helikopter som skal til og frå vedlikehald hos KAMS, ellers er Kjeller mykje brukt av lokale flyklubbar og private småfly. Forsvarets forskingsinstitutt (FFI) og Institutt for energiteknikk har kontor like ved, og OsloMet har ein studiestad like i nærleika.
I 2023 flytter Forsvaret frå Kjeller flyplass, og flybasen blir avvikla i tråd med Stortingets vedtak i langtidsplanen. Forsvarsbygg, som er grunneigar, er i gong med å selje det 1100 dekar store området sentralt mellom Lillestrøm og E6. Les meir om salet hos Forsvarsbygg.